第一，自驾游对景区体系的挑战。
我国的旅游景区体系广义来说包括了各类A级景区、国家风景名胜区、世界文化遗产和世界自然遗产、国家地质公园、国家森林公园、历史文化名城等多套相互交叉又有所不同的系统。
自驾游是多数是无景点度假旅游，自驾游的发展打破了传统的景区体系，而使得自驾线路、风光带、河（海）滨廊道、区域内环线受到关注；一些冷点的、新兴的地区代替传统景区成为旅游线路节点。高流动性和随机性强，使得自驾游流动从点到面扩散，很难被限定在一个固定的景区或线路上。对游览的需求甚至在沿途就已经被满足。
从国际范围来看，无论是在自驾游发展历史上占据一席之地的美国66号公路，风景优美的加州1号公路，还是中国近两年兴起的草原自驾线路“草原天路”，都是典型的线路型产品。 虽然当前国内自驾游在流向上仍有相当大的比例流向A级景区，尚未显现出市场分层、分流的变化。但这很大一部分原因是当前国内自驾游专项产品缺乏，相当部分的市场需求被抑制和转移的结果。
第二，自驾游对旅行社体系挑战巨大。
散客化趋势对旅行社体系冲击巨大，个人出游是我国当前自驾游的主流形式，超过一半，占54.12%，其次是自驾游俱乐部组织出游，占13.32%，通过旅行社出游9.64%，相关网站和车友会占7.91%，4S店6.53%，广播、报纸平面媒体3.1%，自驾游组织者的多元化趋势非常明显，这是对传统旅行社的巨大挑战。
在携程等OTA和自驾游俱乐部的双重夹击之下，我国旅行社行业发展处境困难，截止2014年，全国26650家旅行社，利润只有33.22亿元，同比增长1.52%，是名符其实的微利行业。一些旅行社关注到自驾游领域的商机，纷纷设立自驾游部门，建立全国的自驾游销售网络，但往往因“玩法”不同，知难而退。
自驾游游客的招徕、组织、服务、互动、导游等较之旅行社都发生了很大的变化，自驾游客通常通过新媒体的方式招徕、通过搭建平台，维护社区，提高客户黏性，服务社区用户而达到多元化盈利的目的，这和以往的旅行社赚取差价的模式存在很大的不同。
第三，自驾游对住宿体系的挑战。
经过三十多年的发展，我国已经形成了包括高端酒店、经济型酒店、青年旅社、民宿、酒店式公寓、短租房、木屋等多种类型的住宿产品谱系。自驾游对传统住宿业的挑战在于，第一，面对占据半壁江山的自驾游市场，传统住宿业需要考虑自驾客人的需求，进行设施和服务的改造和升级。第二，围绕自驾游需求而形成的新的住宿业态，对传统领域将构成一定的冲击。
在住宿产品谱系中，民俗、客栈、木屋、帐篷等均属于非标准性住宿，当前这一部分在国内发展迅速，丰富和完善了我国住宿产品类型，但同时也对传统的住宿业态构成了一定的冲击。
在自驾游领域，围绕自驾游客、房车游客等建立的汽车营地和露营区，无论从经营模式还是地理布局上，都打破了以往的住宿业的运营方式，成为未来最具投资潜力和发展前途的领域。此外，特别是以airbnb为代表的共享经济发展，成为非标准住宿的集中平台，推动了个人住宿供给，也将对传统体系带来挑战。
第四，自驾游对旅游交通体系的挑战。
有别于团队旅游时期，空运、水运、铁路加大巴车的交通模式，自驾游通常以汽车为交通工具，以高速路为依托、包括一部分的国道、省道甚至乡村公路。在交通上通常是小尺度、多节点、一程多站式的行程设计。也有相当部分的自驾游以“飞机+租车”、“高铁+租车”的方式开展，这种散客化的旅游方式，要求长途和短途交通之间的高效转换，多种交通工具之间的自由转换。这对交通设施和服务提出了更高的要求。
随着自驾游客的增多，一程多站式的交通方式更为普遍，在一些路段，以往以货运为主的道路服务体系不再能够满足游客的需求，这就对高速路服务区的休闲化改造提出了要求，同时也要求在国道、省道及乡村公路，增设更多的驿站、休息点、加油站、观景台、充电桩等设施和服务。
第五，自驾游对旅游零售业的挑战。
同传统团队旅游购物不同，自驾游客购买的数量、种类、场所都发生了变化。从数量来说，当前自驾游群体是中国的中上收入阶层，游客购物随意性强，再加之汽车后备箱储存空间大，如果目的地旅游商品开发得当，会吸引自自驾游客装满后备箱，购物消费的潜力巨大。
从种类来说，自驾游客更倾向购买目的地的土特产、有机食品、特色商品，甚至是大件商品，而非以往便于携带的旅游纪念品。例如，乌兰察布市的特色产业皮草服装成为除了草原风情之外，最为吸引自驾游客的重要因素。 并且，在专业的户外自驾中，自驾游客还会添置更多的汽车用品，如婴儿座椅、导航仪、手台、防滑链、维修工具、帐篷、休闲服装、烧烤设施等车载用品和户外活动用品。
从购物场所看，自驾游客交通方便，更深入目的地的城镇和乡村，更倾向于在当地人购物的场所进行消费。这对传统的旅游商品开发、销售都产生了很大的影响。
第六，自驾游对公共服务体系的挑战。
自驾车旅游需求是人-车双核驱动的，人的需求包括食、住、游、购、娱、信息、安全、医疗等多个方面；车的需求包括了路（路网、路况）、加油、停车、修理、救援等方面， 这些方面的服务，有的是需要私人部门提供的，有的是需要政府提供的公共服务。
以往政府提供的公共服务，是人车分离的两个系统，但是，自驾游需求兴起之后，人-车互动合一而产生了一系列新的需求，能够填满后备箱的购物需求、露营地、汽车旅馆、汽车娱乐、公共安全救援、交通服务等。
这对原有并不太完善的旅游公共服务体系构成很大的挑战，需要打通旅游者公共服务和车辆公共服务两个体系，并在未来围绕人-车两个要素来配置和布局公共设施和服务，在旅游咨询服务、旅游交通服务、安全保障服务、卫生医疗服务、紧急救援服务等方面做出突破性的创新。